馬英九一來到貴賓區的現場之後，第一個向李登輝握手致意，他在發表完就職演說後，又再次走向李登輝，兩個人的手握了好久，看起來比其他黨內同志熱絡多了。

    為了就職大典座位怎麼排的問題，國民黨主席吳伯雄發了一頓牢騷，才讓馬蕭辦公室把他的位子排進貴賓區，而且就在馬英九的身後，此舉雖然有馬英九背後推手的意味，不過吳伯雄終究還是坐在第二排。

    李登輝的座位則是在馬英九、蕭萬長夫婦的旁邊，等於是貴賓當中的首席位置，再加上他的夫人曾文惠，然後才是馬媽媽秦厚修。現場有人開玩笑說，還好陳水扁和呂秀蓮沒來，否則馬媽媽要看到兒子，可能距離要更遠了。

    臺灣政要的貴賓席一共有22的位子，扣掉馬蕭夫婦的4個位子，剩下的18個位子讓想要坐上去的人搶破頭，更讓安排位子的馬蕭辦公室傷透腦筋，結果卻是原本沒打算來的李登輝距離馬英九最近，而黨政要員與李登輝的互動表現，更是讓人玩味不已﹗